Die Elektrophorese findet besonders in der Medizin und der Biologie Anwendung, sie gibt Auskunft über die Zusammensetzung der Gemische. Der Begriff bezeichnet die Wanderung elektrisch geladener Teilchen durch einen Stoff in einem elektrischen Feld. Dieser Stoff wirkt dabei als Trägermaterial. 

Bei der Gelelektrophorese wechselwirkt das Verhältnis zwischen Teilchenradius und Porenweite des als Trägermedium dienenden Gels. Da dieses Gel als Molekularsieb wirkt, bewirkt ein größerer Teilchenradius eine stärkere Hemmung auf die Wanderungsgeschwindigkeit als die Viskosität allein. Aufgrund der unterschiedlichen Ionenladung und dem Teilchenradius bewegen sich die einzelnen Moleküle deshalb unterschiedlich schnell durch das Trägermaterial und erreichen eine Auftrennung entsprechend ihrer elektrophoretischen Mobilität. Aus diesem Grund eignet sich die Elektrophorese besonders gut zur Trennung von Stoffgemischen, besonders von Molekülgemischen wie beispielsweise Blut. Als Trägermaterial können Flüssigkeiten, Gele oder Feststoffe zum Einsatz kommen. Bei der Elektrophorese hat man somit die Möglichkeit, Moleküle unterschiedlicher Länge und Größe voneinander zu trennen und zu identifizieren.